Die Medizinische Fakultät der Universität Augsburg verleiht derzeit die Doktorgrade Dr. med. im Fach der Humanmedizin und Dr. rer. biol. hum.im Fach der Humanbiologie.

Im weiteren Aufbau der Universitätsmedizin Augsburg wird zum Jahr 2022 für Promovierende mit einer fachlich einschlägigen Abschlussprüfung in einem naturwissenschaftlichen Fach die Möglichkeit eröffnet, den Doktorgrad der Naturwissenschaften (Dr. rer. nat) zu erlangen. Die Promotionsordnung dazu befindet sich in Bearbeitung.