Cell Segmentation Free Analysis of Spatial Transcriptomics Data

Event Details
Date: 23.01.2024, 17:30 o'clock - 18:30 o'clock 
Location: Großer Hörsaal Universitätsklinikum, Stenglinstraße 2, 86156 Augsburg
Organizer(s): Lehrstuhl für Biomedizinische Informatik, Data Mining und Data Analytics
Topics: Informatik, Gesundheit und Medizin
Series of events: Medical Information Sciences
Event Type: Vortragsreihe
Speaker(s): Naveed Ishaque, Ph.D.
BIOINF ASFDASDF DSFASF ASDF ASDF © University of Augsburg

In diesem Wintersemester wird die im letzten Jahr erfolgreich gestartete Vortragsreihe Medical Information Sciences fortgesetzt. Renommierte Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler unterschiedlicher Fachdisziplinen und Forschungsstandorte geben jeden Dienstag ab 17:30 Uhr Einblicke in aktuelle Fragestellungen und Anwendungsgebiete des breiten Forschungsfeldes Medical Information Sciences.


Spatial transcriptomics technologies have revolutionised how we characterise cellular systems - they are able to profile gene expression in the native tissue context, thus preserving cellular organisation in tissue and niches. In this talk I will present some of the challenges associated with analysis spatial transcriptomics data, in particular cell segmentation, and how we are trying to develop tools to address these issues.

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