Cell Segmentation Free Analysis of Spatial Transcriptomics Data

Veranstaltungsdetails
Datum: 23.01.2024, 17:30 Uhr - 18:30 Uhr 
Ort: Großer Hörsaal Universitätsklinikum, Stenglinstraße 2, 86156 Augsburg
Veranstalter: Lehrstuhl für Biomedizinische Informatik, Data Mining und Data Analytics
Themenbereiche: Informatik, Gesundheit und Medizin
Veranstaltungsreihe: Medical Information Sciences
Veranstaltungsart: Vortragsreihe
Vortragende: Naveed Ishaque, Ph.D.
BIOINF ASFDASDF DSFASF ASDF ASDF © Universität Augsburg

In diesem Wintersemester wird die im letzten Jahr erfolgreich gestartete Vortragsreihe Medical Information Sciences fortgesetzt. Renommierte Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler unterschiedlicher Fachdisziplinen und Forschungsstandorte geben jeden Dienstag ab 17:30 Uhr Einblicke in aktuelle Fragestellungen und Anwendungsgebiete des breiten Forschungsfeldes Medical Information Sciences.


Spatial transcriptomics technologies have revolutionised how we characterise cellular systems - they are able to profile gene expression in the native tissue context, thus preserving cellular organisation in tissue and niches. In this talk I will present some of the challenges associated with analysis spatial transcriptomics data, in particular cell segmentation, and how we are trying to develop tools to address these issues.

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